Miljøpartiet De Grønne (MDG) foreslår en omfattende endring i fordelingen av midler fra Havbruksfondet, med mål om å styrke den hardt pressede villaksbestanden. Rasmus Hansson (MDG) peker på at villaksen er på et historisk bunnivå, og at fondet bør belønne kommuner som stiller høye miljøkrav til oppdrettsnæringen, fremfor kun å premiere arealutrulling.
Han ønsker også mer kompensasjon til eleveierlagene. Regjeringen, ved Kristina Hansen (Ap), anerkjenner behovet for bedre incentiver for bærekraftig drift og har lagt frem en stortingsmelding om et nytt forvaltningssystem for akvakultur.
Sjømat Norge, representert ved Jon Arne Grøttum, er uenig i MDGs forslag om å ta penger fra Havbruksfondet til eleveierlagene, og mener fondet primært skal kompensere kommuner for tilrettelegging av sjømatproduksjon. Grøttum understreker at næringen jobber med å redusere rømming og håndtere lakselus.